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Publications

Articles scientifiques du 20 mars au 24 avril

Covid-19 : les campagnes moins touchées que les villes ?

La pandémie de Covid-19 touche-t-elle moins les campagnes que les grandes villes ? En croisant plusieurs ressources cartographiques et statistiques, l’urbaniste Clément Payet formule de premières hypothèses.

Métropolitiques, 2020-04-23

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Cluster of Covid-19 in northern France : a retrospective closed cohort study

Fin mars 2020, 661 personnes reliées à un lycée de Crépy-en-Valois (Oise) ont fait l'objet d'une investigation épidémiologique menée par les chercheurs de l’Institut Pasteur avec le soutien de l'Agence régionale de la santé des Hauts-de-France et de l'Académie d'Amiens, avec l’appui de l’Etablissement Français du Sang. Grâce à la population de Crépy-en-Valois, et suite à l’utilisation de tests de détection du virus, associés à trois tests sérologiques développés par l’Institut Pasteur, cette étude révèle que 26% de la population étudiée a été infectée par le SARS-CoV-2 et possède des anticorps contre ce virus.

MedRxiv, preprint 2020-04-23

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Clinical characteristics of coronavirus disease (COVID-19) early findings from a teaching hospital in Pavia, North Italy, 21 to 28 February 2020

Cette étude décrit les caractéristiques cliniques, traitements et résultats de 44 patients caucasiens atteints de coronavirus dans un hôpital de Pavie, en Italie, du 21 au 28 février 2020, au début de l'épidémie en Europe.

Eurosurveillance, 2020-04-23

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Suivi des sorties déclarées par les Français en période de confinement

Depuis presque cinq semaines, la stratégie de confinement de la population est la pierre angulaire de la lutte contre l’épidémie Covid-19 en France, comme dans d’autres pays. Elle ne vise pas à stopper l’épidémie mais à la ralentir, de façon à en écrêter le pic et à limiter le flux d’hospitalisations, tout particulièrement en réanimation. Le suivi dans le temps de la compliance de la population au confinement est donc un paramètre essentiel pour les pouvoirs publics afin d’adapter, le cas échéant, les modalités de son application. La présente note reprend les résultats des quatre premières vagues de COCONEL pour explorer les sorties déclarées par les Français, leur durée et leurs motifs.

COronavirus et CONfinement : Enquête Longitudinale, ORS Paca, 2020-04-24

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Coconel : 2 nouvelles notes de synthèse

Deux nouvelles notes de synthèses ont été publiées :

La note n° 4 revient sur les résultats de la 2ème vague (1005 enquêtés, interrogés du 31 mars au 02 avril), réalisée après deux semaines de confinement. Elle aborde les perceptions que les Français ont des risques induits par l’épidémie COVID-19, en lien avec leurs comportements durant le confinement.

La note n° 5 détaille les principaux résultats de la quatrième vague (1006 enquêtés, interrogés du 15 au 17 avril), réalisée donc après un mois de confinement, sur les aspects suivants : confinement et conditions de vie ; détresse psychologique et troubles du sommeil ; proximité subjective au COVID-19 ; opinions à l’égard du confinement ; pronostic sur la durée de l’épidémie.

COronavirus et CONfinement : Enquête Longitudinale, ORS Paca, 2020-04-21

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Why health promotion matters to the Covid-19 pandemic, and vice versa

Dans cet éditorial, Stephan Van den Broucke, professeur de psychologie de la santé à l'Université catholique de Louvain, en Belgique, envisage le rôle de la promotion de la santé pendant la crise sanitaire actuelle. Permettre aux gens de mieux contrôler leur santé et ses déterminants est au coeur de la promotion de la santé. En tant que telle, la promotion de la santé peut paradoxalement être plus importante que jamais en cette période de crise. Elle peut contribuer à lutter contre la menace du virus CoV-2 à différents niveaux : en aval, en se concentrant sur le changement de comportement individuel et la gestion des maladies, au niveau intermédiaire par des interventions affectant les organisations et les communautés et en amont par des politiques d'information.

Health Promotion International, 2020-04-16

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Personal protective equipment for preventing highly infectious diseases due to exposure to contaminated body fluids in healthcare staff

La Cochrane publie une mise à jour des données de la littérature sur l’efficacité des vêtements et équipements de protection individuels contre le coronavirus SARS-CoV-2.

Cochrane Systematic Review, 2020-04-15

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Temporal dynamics in viral shedding and transmissibility of Covid-19

Cette étude, parue dans la revue Nature, porte sur les cas d'infection au stade présymptomatique et conclut que les mesures de contrôle de la maladie doivent être ajustées pour tenir compte d'une transmission présymptomatique substantielle probable.

Nature medecine, 2020-04-15

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Potential lethal outbreak of coronavirus disease (Covid-19) among the elderly in retirement homes and long-term facilities, France, March 2020

Les auteurs ont étudié différents scénarios pour simuler le nombre potentiel de morts d'une épidémie de Covid-19 dans les maisons de retraites et les établissements de longue durée en l'absence de mesures d'atténuation.

Jean-François Etard, Philippe Vanhems, Laëtitia Atlani-Duault et al., EuroSurveillance, 2020-04-15

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Coronavirus disease (Covid-19) : a scoping review

Cette étude vise à comprendre les lacunes de recherche liées à Covid-19 et à proposer des recommandations pour les recherches futures.

Eurosurveillance, 2020-04-15

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Covid-19 : health literacy is an underestimated problem

Les auteurs décrivent ici le rôle de la littératie en santé dans la situation épidémique actuelle. L'infodémie Covid-19 a mis en évidence que la faible littératie en santé d'une population est un problème de santé publique sous-estimé à l'échelle mondiale.

The Lancet Public Health, 2020-04-14

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Scénarios du nombre de décès, d'hospitalisations et d'admissions en réanimation construits à partir des caractéristiques des cas de covid-19 observés dans la province de Hubei, Chine

Ce rapport rend compte d’un travail de projection des données chinoises disponibles, à la France et leur comparaison à la grippe saisonnière. Les résultats indiquent que l’impact sera supérieur, voire très supérieur, à celui de la grippe saisonnière, en particulier du fait des capacités françaises en lits de réanimation, au moins dans le cas des scénarios 2 et 3. Ces projections justifient d’une part de fortes mesures d’atténuation afin de limiter la pression sur le système de santé et d’autre part de préparation opérationnelle et d’organisation du système de soin.

Santé publique France, 2020-04-15, 22 p.

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Universal Screening for SARS-CoV-2 in Women Admitted for Delivery

Dans une correspondance publiée dans The New England Journal of Medicine , des obstétriciens au centre médical Irving de la Columbia University à New York rendent compte de leur observation après avoir mis en place un dépistage systématique des parturientes dans leur maternité.

New England Journal of Medicine, 2020-04-13

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Expected impact of lockdown in Île-de-France and possible exit strategies

L’équipe de recherche de l'Institut Pierre-Louis d’épidémiologie et de santé publique, Inserm et Médecine Sorbonne Université rend compte d'une analyse pour évaluer la situation épidémique actuelle, évaluer l'impact attendu du verrouillage mis en place en France le 17 mars 2020 , et estimer l'efficacité de stratégies de sortie possibles.

Laura Di Domenico, Giulia Pullano, Chiara E.Sabbatini et al., EPIcx lab, 2020-04-12 [en ligne]

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Epidémie de coronavirus - point sur les technologies de l'information utilisées pour limiter la propagation de l'épidémie de Covid-19

L'Office parlementaire d'évaluation des choix scientifiques et technologiques publie une note sur les technologies de recherche de cas contact. Elle aborde cette problématique en trois temps : l'aspect technologique, l'aspect organisationnel et l'aspect éthique du traitement des données.

Office parlementaire d'évaluation des choix scientifiques et technologiques, 2020-04-11, 13 p.

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Quarantine alone or in combination with other public health measures to control Covid-19 : a rapid review

Cette revue de littérature montre l'efficacité de la quarantaine dans la lutte contre l'épidémie.

Barbara Nussbaumer‐Streit, Verena Mayr, Andreea Iulia Dobrescu et al., Cochrane Library, 2020-04-08, 46 p.

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Excess cases of influenza-like illnesses synchronous with coronavirus disease (Covid-19) epidemic, France, March 2020

Plusieurs régions françaises où la maladie à coronavirus a été signalée montrent actuellement une nouvelle augmentation des cas de syndromes grippaux dans le réseau Sentinelles en médecine générale. Le réseau a calculé le nombre de cas excédentaires par région du 24 février au 8 mars 2020 et trouvé une corrélation avec le nombre de cas de COVID-19 signalés jusqu'à présent. Les données suggèrent une plus grande circulation de coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) dans la population française que ce qui ressort des cas confirmés.

Pierre-Yves Boëlle, Cécile Souty, Titouan Launay et al., Eurosurveillance, vol. 25 n°14, 2020-04-09

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Contact tracing : public health management of persons, including healthcare workers, having had contact with Covid-19 cases in the European Union

Ce document vise à aider les autorités de santé publique de l'Union européenne dans la recherche et la gestion des personnes, y compris les agents de santé, qui ont été en contact avec des cas de Covid-19. Il décrit les étapes clés de la recherche des contacts, y compris l'identification, la liste et le suivi des contacts.

European Centre for Disease Prevention and Control, 2020-04-09, 7 p.

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Covid-19 : what is the evidence for cloth masks ?

Le British medical journal examine les preuves de l'efficacité de la consigne de porter des masques en tissu, à défaut de masques médicaux.

BMJ, 2020-04-07

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Prediction models for diagnosis and prognosis of covid-19 infection : systematic review and critical appraisal

Cet article présente une analyse critique des rapports publiés et préimprimés des modèles de prédiction pour diagnostiquer la maladie à covid-19, pour le pronostic des patients et pour détecter les personnes dans la population générale risquant d'être admises à l'hôpital pour une pneumonie covid-19.

Laure Wynants, Ben Van Calster, Marc M.J. Bonten, et al., The BMJ, 2020-04-07

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Covid-19 : les symptômes peuvent être neurologiques ?

L'auteur analyse et synthétise de nombreuses références parues sur les manifestations de la maladie Covid-19 sous forme neurologique.

Marc Gozlan, Réalités Biomédicales, 2020-04-07 [en ligne]

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Projet Coconel : premières notes de synthèses

L’enquête COCONEL (COronavirus et CONfinement - Enquête Longitudinale) est réalisée par internet. Deux fois par semaine, un échantillon d’un millier de personnes, représentatif de la population adulte française, est interrogé avec un questionnaire couvrant divers aspects de la crise actuelle. La première note détaille les principaux résultats de la première vague (1012 enquêtés, interrogés du 27 au 29 mars), réalisée donc après 10 jours de confinement, sur les aspects suivants : confinement et conditions de vie ; proximité personnelle au COVID-19 ; opinions à l’égard du confinement ; pronostic sur la durée de l’épidémie.

La seconde note détaille les principaux résultats de la seconde vague (1005 enquêtés, interrogés du 31 mars au 2 avril), réalisée donc après deux semaines de confinement, et revient sur certains aspects encore inexploités de la vague 1 : les troubles du sommeil, les signes de détresse psychologique, la proximité personnelle au Covid-19, l’acceptabilité d’un vaccin contre le Covid-19 et enfin le pronostic sur la durée de l’épidémie.

Note de synthèse n°1. Confinement et conditions de vie

Note de synthèse n° 2. Impact sur la santé mentale - Acceptabilité d'un futur vaccin


How sewage could reveal true scale of coronavirus outbreak

Un article paru dans la revue Nature envisage les eaux usées comme signe d'alerte de la présence du virus. Plus d'une douzaine de groupes de recherche dans le monde ont commencé à analyser les eaux usées comme un moyen d'estimer le nombre total d'infections, étant donné que la plupart des gens ne seront pas testés. La méthode pourrait également être utilisée pour détecter le coronavirus s'il revient.

Smriti Mallapaty, Nature, 2020-04-03, pp. 176-177

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Quantifying SARS-CoV-2 transmission suggests epidemic control with digital contact tracing

Des chercheurs de l'Université d'Oxford publient une étude sur la recherche numérique de contacts par le bais d'application sur téléphone dans le but de contrôler la propagation virale.

Luca Ferretti, Chris Wymant1, Michelle Kendall et al., Science, 2020-03-31

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Covid-19 : le risque de transmission par des porteurs sains se confirme

Les personnes qui ont été exposées au nouveau coronavirus peuvent-elles être infectées et excréter du virus sans développer de symptômes ? Cette hypothèse, largement évoquée, doit être vérifiée selon une méthode scientifique. C'est précisément l'objet d'une étude menée en France depuis fin février, dont les premiers résultats semblent le confirmer, soutenant l'intérêt du confinement.

Inserm - La science pour la santé, 2020-04-01

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Estimating the number of infections and the impact of non-pharmaceutical interventions on COVID-19 in 11 European countries

Une étude publiée sur le site de l’Imperial College de Londres propose une analyse statistique du nombre de morts évités par les mesures de distanciation sociale.

Seth Flaxman, Swapnil Mishra, Axel Gandy et al., Imperial college London, 2020-03-30, 35 p.

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Acceptabilité d'une application téléphone pour tracer les contacts porteurs du Covid-19

Cette étude, menée par le département d'Economie de l'Université d'Oxford, a interrogé 1010 personnes représentatives de la population française pour analyser les questions suivantes : quelle est l'opinion générale sur l'utilisation d'une telle application ? Quelles sont les raisons pour ou contre ? Comment influencer son adoption ? Faut-il envisager un mode volontaire ou automatique.

University of Oxford, 2020-03-31, 36 p.

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Estimates of the severity of coronavirus disease 2019 : a model-based analysis

Une équipe de l'Imperial College London a cherché à modéliser l'analyse des taux de mortalité, en tenant compte des biais de vérification des données. Les premières estimations montrent un fort gradient d'âge dans le risque de décès.

Robert Verity, Lucy C. Okell, Ilaria Dorigatti et al., The Lancet, 2020-03-30

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Covid-19 : prévenir l'exposition au virus en milieu professionnel

L’Anses s’est penchée sur la prévention des expositions pour fournir des recommandations aux employeurs pour la protection de leurs salariés. Avant toute mesure de prévention technique ou organisationnelle spécifique, il est essentiel d’appliquer les principes de base de la prévention de l’infection par le virus SRAS-CoV-2 que sont les mesures de distanciation sociale et les « gestes barrières ». Les équipements de protection individuelle et équipements de travail, tels les masques, permettent de diminuer les risques d’exposition lorsqu’ils sont utilisés correctement. Toutefois, ils ne remplacent pas les autres actions de prévention : les « gestes barrières » et les mesures d’organisation du travail prises par l’employeur.

Note d’appui scientifique et technique de l'Anses relative à la proposition d’orientations utiles pour la prévention de l’exposition au virus SRAS-CoV-2 en milieu professionnel, dans des contextes autres que ceux des soins et de la santé, 2020-03-26, 17 p.

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The effect of control strategies to reduce social mixing on outcomes of the Covid-19 epidemic in Wuhan, China : a modelling study

Cette étude de modélisation de la London School of Hygiene & Tropical Medicine (UK) porte sur l'impact des mesures de distanciation physique via le confinement notamment, sur la progression de l'épidémie de Covid-19 à Wuhan et suggère qu'il faut les poursuivre suffisament longtemps pour éviter un deuxième pic trop précoce.

Kiesha Prem, Yang Liu, Timothy W. Russell, et al., The Lancet Public Health, 2020-03-25, 10 p.

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Covid-19 et essais de médicaments : que faire des premiers résultats d'évaluation ?

Au 23 mars 2020, on ne dispose pas de résultats d'essai pertinent montrant une éventuelle efficacité de l'hydroxychloroquine associée ou non avec l'azithromycine. Et absence d'efficacité de l'association lopinavir + ritonavir en cas de covid-19 sévère selon les résultats d'un essai randomisé. Avant d’en savoir plus, mettre l'efficacité hypothétique du médicament proposé en balance avec ses effets indésirables déjà connus et prévisibles, pour éviter d'ajouter du mal au mal.

Prescrire, 2020-03-23 [en ligne]

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Factors Associated With Mental Health Outcomes Among Health Care Workers Exposed to Coronavirus Disease 2019

Uen étude chinoise montre que les professionnels de santé qui prennent en charge les patients atteints de Covid-19 sont particulièrement exposés sur le plan psychologique. Ils présentent un risque accru de faire une dépression et développer une anxiété, des insomnies ou un stress post-traumatique, les plus touchés étant les femmes, les infirmiers et les soignants de première ligne.

Jianbo Lai, Simeng Ma, Ying Wang et al., JAMA Network Open, 2020-03-23, 12 p.

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Information sur des formes cliniques atypiques de Covid-19

La DGS informe les professionnels de santé sur des formes cliniques atypiques de Covid-19. En effet, le Conseil national professionnel de gériatrie et la Société française de gériatrie et gérontologie ont confirmé la symptomatologie atypique du Covid-19 chez les sujets âgés, indépendamment des signes respiratoires plus classiques, se traduisant par des signes digestifs (notamment diarrhée), un état confusionnel ou des chutes, une fébricule avec variations de température entre hyper et hypothermie. Par ailleurs, le Conseil national professionnel d’ORL a constaté la recrudescence d’anosmie brutale sans obstruction nasale, parfois isolée qui pourrait être en relation avec le Covid-19.

DGS-Urgent, 2020-03-22

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Relationship between the ABO Blood Group and the COVID-19 Susceptibility

Une étude chinoise, publiée en preprint le 20 mars 2020, porte sur le lien entre le groupe sanguin et la sensibilité au coronavirus.

medRxiv - The Preprint Server for Health Sciences, 2020-03-20, 18 p.

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Lire une présentation de l'étude sur le site de France info (en français)


Manuel de prévention et de traitement du Covid-19

Ce guide de prévention et de traitement de COVID-19, rédigé par des experts de de l'hopital affilié à lUniversité de Zhejiang, en Chine, décrit comment les organisations peuvent minimiser les coûts tout en maximisant l'effet des mesures de gestion et de contrôle de l'épidémie de coronavirus.

Il comprend les éléments suivants :

  • Stratégies techniques pour résoudre les problèmes lors des situations d'urgence.
  • Méthodes de traitement pour traiter les personnes gravement malades.
  • Aide à la décision clinique efficace.
  • Meilleures pratiques pour les départements clés comme la gestion des inflexions et les cliniques externes.

Tingbo LIANG, The First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, 2020, 68 p.

Accédez au guide


Guidance for health system contingency planning during widespread transmission of SARS-CoV-2 with high impact on healthcare services

Ce document vise à soutenir la planification et les activités dans le contexte d'une transmission de Covid-19. Il donne les principes directeurs pour la planification d'urgence, au sein de l'hopital et en soins ambulatoires.

European Centre for Disease Prevention and Control, 2020-03-17, 5 p.

Accédez au document (en anglais)


The proximal origin of SARS-CoV-2

Dans cette publication parue dans Nature Medicine , le 17 mars 2020, les auteurs confirment l'origine naturelle du virus et émettent deux hypothèses sur sa transmission à l'homme et sa pathogénicité

Kristian G. Andersen, Andrex Rambaut, W. Ian Lipkin et al., Nature medecine, 2020-03-17, 3 p.

Lire l'article (en anglais)

Lire la dépêche de APM (en français)


Aerosol and Surface Stability of SARS-CoV-2 as Compared with SARS-CoV-1

Une étude publiée le 17 mars par le New England Journal of Medicine et menée par des scientifiques des Centres de contrôle et de prévention des maladies (CDC), de l'Université de Californie à Los Angeles et de Princeton précise le niveau de viabilité du virus dans l'air et sur les surfaces en plastique, en cuivre, en acier inoxydable et sur du carton.

The New England Journal of Medicine, 2020-03-17, 3 p.

Lire l'article (en anglais)

Article en français sur le site France Info


The psychological impact of quarantine and how to reduce it : rapid review of the evidence

Cette méta-analyse de psychologues du King’s College London informe et alerte sur ces effets négatifs du confinement, pendant et à l'issue de la période.

Samantha K. Brooks, Rebecca K. Webster, Louise E. Smith et al., The Lancet, vol. 395 n°10227, 2020-03-14, pp. 912-920

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Veille quotidienne Spécial Covid-19 - service Documentation de l'ARS Paca

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Plateforme d'informations Covid-19 dédiée aux professionnels de santé

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Site des prépublications de l'IHU sur le Covid-19

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REACTing : revue de littérature commentée

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National Collaborating Centre for Methods and Tools

Recommandations et référentiels en gynécologie-obstétrique et Covid-19

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metaEvidence Covid-19

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Mise au point quotidienne sur le Covid-19

par Dr Michel Nahon, Urgences-online

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Covid-19 : A living mapping on registered trials

par Cochrane France, l'Université de Paris, l'INSERM et l'AP-HP

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Informations sur l'épidémie de nouveau
coronavirus (Covid-19)

par le Réseau de Prévention des Infections Associées aux Soins

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Covid-19 : ressources documentaires pour la psychiatrie

Ascodocpsy a créé une page regroupant les ressources sur le Coronavirus / Covid-19 des centres de documentation, bibliothèques, réseaux documentaires, sociétés savantes en France et à l’étranger, avec un focus sur celles concernant la psychiatrie.

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Covidocumentation

Veille documentaire par les membres des associations SIDOC et Rndh.

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Mise à disposition des données de recherche sur le centre d'information Covid-19 d'Elsevier

Les données sont mises à la disposition de PubMed Central, les archives de la biomédecine et de la science de la vie de la National Library of Medicine des National Institutes of Health des Etats-Unis, et d'autres référentiels financés par des fonds publics dans le monde entier, comme la base de données Covid-19 de l'OMS.

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Santé publique France : accès à la veille documentaire sur le coronavirus Covid-19

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INSERM : dossier d'information mis à jour

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The Lancet : centre d'information Covid-19

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Covid-19 : ressources documentaires du CISMeF

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Pubmed : tous les articles sur le Covid-19 

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Johns Hopkins University & Medecine : coronavirus resource center

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British Medical Journal - Covid-19 : Latest news and resources

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Coronaclic - Toutes les informations utiles pour le médecin généraliste

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Hospices civils de Lyon : ressources documentaires Covid-19

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